摘要
目标:目的探讨肺腺癌(LUAD)中外泌体相关的分子分类。 背景:外泌体基因或相关非编码rna是癌症治疗和预后的调节因子,但其在LUAD中的功能尚未确定。 目的:应用外泌体相关RNA网络揭示LUAD预后评估的分子分类。 方法:MicroRNA测序数据(miRNAs-seq)和RNA测序数据(RNA- seq)来源于The Cancer Genome Atlas (TCGA)。使用ConsensusCluster- Plus软件包基于121个外泌体相关基因对LUAD进行分子分型。然后,利用limma包对差异表达mrna (demrna)、差异表达miRNAs (DEmiRNAs)和差异表达lncRNAs (DElncRNAs)进行分子分型,构建外泌体驱动的竞争内源性RNA网络(ceRNA)。通过COX建模和Kaplan-Meier生存分析鉴定优势mirna和靶mrna。 结果:LUAD中分类的两个外泌体相关分子簇。C2组临床病理高,预后差。共鉴定出29对lncRNA- miRNA和12对miRNA- mrna互作对。hsa-miR-429是影响LUAD预后的网络中的关键miRNA。根据相互作用关系和LUAD预后作用,鉴定出SNHG6-hsa- miR-429-CHRDL1/CCNA2。SNHG6-hsa-miR-429- chrdl1具有促癌作用,SNHG6-hsa-miR-429- CCNA2具有促癌作用。 结论:总的来说,我们的研究发现了LUAD中exosome驱动的ceRNA网络,SNHG6-hsa-miR-429-CHRDL1/CCNA2轴可能是LUAD的新治疗靶点,我们的研究为LUAD的分子机制提供了新的见解。
关键词: 肺腺癌,外泌体,ceRNAs, hsa-miR-429, CHRDL1, CCNA2。
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